Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 CNOT1-209ENST00000566240 567 ntTSL 45.81□□□□□ -1.482e-6■□□□□ 11.1
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G3BP1Q13283 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.353e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.22e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.612e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DDC-209ENST00000489162 671 ntTSL 320.01■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.681e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DNAJB11-204ENST00000495390 4079 ntTSL 28.62□□□□□ -1.032e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.057e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.657e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 EPAS1-202ENST00000449347 1067 ntTSL 323.05■■□□□ 1.283e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 EPAS1-204ENST00000463191 559 ntTSL 27.95□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.077e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNNA1-237ENST00000523275 536 ntTSL 514.54□□□□□ -0.082e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 NUMA1-217ENST00000540626 2276 ntTSL 217.92■□□□□ 0.464e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.266e-10■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.246e-10■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.16e-10■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.816e-10■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 HMGCS1-205ENST00000508319 591 ntTSL 316.05■□□□□ 0.164e-13■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.873e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 517.72■□□□□ 0.433e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.383e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 516.29■□□□□ 0.23e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.153e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.023e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 513.58□□□□□ -0.233e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GAPDH-211ENST00000619601 1086 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-47■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt15.93■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FLII-203ENST00000461110 1032 ntTSL 516.35■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FLII-211ENST00000488932 838 ntTSL 316.35■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.266e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FADS1-202ENST00000421879 583 ntTSL 320.72■□□□□ 0.916e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FADS1-219ENST00000545245 709 ntTSL 420.72■□□□□ 0.916e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.856e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.516e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FADS1-203ENST00000424501 926 ntTSL 316.46■□□□□ 0.236e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FADS1-214ENST00000540767 742 ntTSL 315.84■□□□□ 0.136e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 FADS1-220ENST00000545405 582 ntTSL 215.81■□□□□ 0.126e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 SF3B3-210ENST00000567654 334 ntTSL 36.99□□□□□ -1.291e-8■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 SF3B3-213ENST00000569687 333 ntTSL 46.56□□□□□ -1.361e-8■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 DSP-203ENST00000506617 754 ntTSL 318.27■□□□□ 0.523e-20■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 PABPC1-224ENST00000610907 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.388e-11■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CLUH-207ENST00000573641 581 ntTSL 324.43■■□□□ 1.51e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 XRCC6-207ENST00000464116 359 ntTSL 29.5□□□□□ -0.892e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 UQCRC2-211ENST00000567810 582 ntTSL 38.22□□□□□ -1.097e-8■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.781e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.741e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.74e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.264e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.584e-6■□□□□ 11.1
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G3BP1Q13283 GLDC-209ENST00000638694 1614 ntTSL 514.43□□□□□ -0.13e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GLDC-205ENST00000638233 2046 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GLDC-208ENST00000638661 1796 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GLDC-211ENST00000639318 2009 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.393e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 GLDC-220ENST00000640505 1852 ntTSL 512.17□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 224.71■■□□□ 1.556e-29■□□□□ 11.1
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G3BP1Q13283 PSME2-210ENST00000559493 702 ntTSL 26.73□□□□□ -1.331e-16■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.458e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.588e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.678e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.698e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.78e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.78e-9■□□□□ 11.1
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G3BP1Q13283 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.758e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.758e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.758e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.758e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.768e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.768e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.818e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.828e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.838e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.848e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.848e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.848e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.858e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.888e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.888e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.948e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.958e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.018e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.058e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.068e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.068e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.228e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.228e-9■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 HK2-203ENST00000472302 395 ntTSL 35.18□□□□□ -1.583e-8■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 25.07□□□□□ -1.61e-7■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.017e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 MCM3AP-207ENST00000486937 4593 ntTSL 213.25□□□□□ -0.297e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.377e-6■□□□□ 11.1
G3BP1Q13283 MCM3AP-210ENST00000496607 4075 ntTSL 211.76□□□□□ -0.537e-6■□□□□ 11.1
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