Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNE1P24864 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms