Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNAB3O43448 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms