Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDHD3Q9BSH5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDHD3Q9BSH5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms