Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRN4CLQ8ND94 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms