Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITX3O75364 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms