Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOR4AQ9NXH8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOR4AQ9NXH8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms