Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APTXQ7Z2E3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms