Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PRR14-207ENST00000565410 600 ntTSL 222.67■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM241-206ENST00000482411 667 ntTSL 522.63■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.212e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 XXYLT1-208ENST00000473200 698 ntTSL 222.57■■□□□ 1.25e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MTA1-211ENST00000481206 842 ntTSL 222.51■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SSH1-207ENST00000547862 625 ntTSL 522.51■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GRAMD1A-214ENST00000603907 450 ntTSL 222.47■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPP38-204ENST00000378203 1296 ntAPPRIS P1 TSL 222.43■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 522.39■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXL8-202ENST00000517382 543 ntTSL 322.34■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 METTL16-208ENST00000576556 1944 ntTSL 222.25■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COPE-208ENST00000598969 1770 ntTSL 522.24■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TSPAN32-211ENST00000484104 725 ntTSL 222.21■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM3A-217ENST00000457212 905 ntTSL 522.19■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 WDR33-203ENST00000408998 583 ntTSL 422.18■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM106B-205ENST00000444443 584 ntTSL 422.18■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 STK17A-202ENST00000462448 689 ntTSL 522.17■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MVK-212ENST00000546277 886 ntTSL 522.08■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HAUS7-207ENST00000484394 1927 ntTSL 222.06■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GPD1L-205ENST00000431009 621 ntTSL 422.06■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TBC1D9B-209ENST00000519757 1208 ntTSL 222.03■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLRMT-208ENST00000592863 966 ntTSL 522.02■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MDK-212ENST00000533952 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.01■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COPE-204ENST00000593827 601 ntTSL 321.98■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CBARP-203ENST00000589260 929 ntTSL 321.98■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ENGASE-202ENST00000311595 1381 ntTSL 521.96■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRPF19-207ENST00000546152 814 ntTSL 521.96■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALDH16A1-208ENST00000600265 819 ntTSL 321.85■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRR5-212ENST00000477331 1041 ntTSL 221.84■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM3A-210ENST00000426266 936 ntTSL 321.81■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ST3GAL4-214ENST00000531217 1745 ntTSL 521.79■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC009292.2-202ENST00000560577 346 ntTSL 521.74■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF664-211ENST00000542493 591 ntTSL 421.71■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LRP6-202ENST00000535731 562 ntTSL 321.7■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PLEKHG2-212ENST00000595920 431 ntTSL 321.68■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-210ENST00000595806 1659 ntTSL 221.66■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.052e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TSPAN32-214ENST00000493924 1573 ntTSL 521.6■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PHF13-202ENST00000495385 798 ntTSL 321.58■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BID-206ENST00000473439 638 ntTSL 221.57■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TSPAN32-210ENST00000483227 886 ntTSL 1 (best)21.53■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAR2-209ENST00000551451 539 ntTSL 421.52■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EML2-205ENST00000586195 1952 ntTSL 221.49■■□□□ 1.032e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SELENOS-202ENST00000526043 2444 ntTSL 221.45■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRAPPC12-220ENST00000482645 1538 ntTSL 221.44■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.021e-16■■■■■ 137.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1321 ms