RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593827.1

COPE-204, Transcript of coatomer protein complex subunit epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene COPE, Length 601 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPE-204ENST00000593827 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.88■■■■■ 5.41
COPE-204ENST00000593827 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.54■■■■■ 4.56
COPE-204ENST00000593827 ABCC9O60706 1549 aa42.87■■■■■ 4.45
COPE-204ENST00000593827 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.19■■■■■ 4.18
COPE-204ENST00000593827 NACADO15069 1562 aa41.08■■■■■ 4.17
COPE-204ENST00000593827 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.05■■■■■ 4.16
COPE-204ENST00000593827 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.79■■■■■ 4.12
COPE-204ENST00000593827 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
COPE-204ENST00000593827 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.49■■■■■ 4.07
COPE-204ENST00000593827 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 4
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COPE-204ENST00000593827 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.89■■■■□ 3.98
COPE-204ENST00000593827 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.79■■■■□ 3.96
COPE-204ENST00000593827 SCRIBQ14160 1630 aa39.66■■■■□ 3.94
COPE-204ENST00000593827 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.61■■■■□ 3.93
COPE-204ENST00000593827 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
COPE-204ENST00000593827 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.73■■■■□ 3.79
COPE-204ENST00000593827 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.6■■■■□ 3.77
COPE-204ENST00000593827 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
COPE-204ENST00000593827 SMARCA4P51532 1647 aa37.94■■■■□ 3.66
COPE-204ENST00000593827 NCAPD3P42695 1498 aa37.91■■■■□ 3.66
COPE-204ENST00000593827 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.86■■■■□ 3.65
COPE-204ENST00000593827 SMARCA2P51531 1590 aa37.85■■■■□ 3.65
COPE-204ENST00000593827 HMGXB3Q12766 1538 aa37.68■■■■□ 3.62
COPE-204ENST00000593827 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.6■■■■□ 3.61
COPE-204ENST00000593827 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.59■■■■□ 3.61
COPE-204ENST00000593827 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
COPE-204ENST00000593827 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
COPE-204ENST00000593827 WIZO95785 1651 aa37.12■■■■□ 3.53
COPE-204ENST00000593827 ERCC6Q03468 1493 aa37.08■■■■□ 3.53
COPE-204ENST00000593827 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.04■■■■□ 3.52
COPE-204ENST00000593827 NESP48681 1621 aa36.95■■■■□ 3.51
COPE-204ENST00000593827 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.95■■■■□ 3.51
COPE-204ENST00000593827 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.83■■■■□ 3.49
COPE-204ENST00000593827 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
COPE-204ENST00000593827 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.81■■■■□ 3.48
COPE-204ENST00000593827 CUX2O14529 1486 aa36.79■■■■□ 3.48
COPE-204ENST00000593827 CFTRP13569 1480 aa36.51■■■■□ 3.44
COPE-204ENST00000593827 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.45■■■■□ 3.42
COPE-204ENST00000593827 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
COPE-204ENST00000593827 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.39■■■■□ 3.42
COPE-204ENST00000593827 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.37■■■■□ 3.41
COPE-204ENST00000593827 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.37■■■■□ 3.41
COPE-204ENST00000593827 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.36■■■■□ 3.41
COPE-204ENST00000593827 WDR62O43379 1518 aa36.19■■■■□ 3.38
COPE-204ENST00000593827 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
COPE-204ENST00000593827 PRDM2Q13029 1718 aa36.05■■■■□ 3.36
COPE-204ENST00000593827 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
COPE-204ENST00000593827 ABCC8Q09428 1581 aa35.84■■■■□ 3.33
COPE-204ENST00000593827 TOPBP1Q92547 1522 aa35.72■■■■□ 3.31
COPE-204ENST00000593827 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.66■■■■□ 3.3
COPE-204ENST00000593827 IFT140Q96RY7 1462 aa35.64■■■■□ 3.3
COPE-204ENST00000593827 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
COPE-204ENST00000593827 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
COPE-204ENST00000593827 SOGA1O94964 1423 aa35.32■■■■□ 3.24
COPE-204ENST00000593827 CUX1P39880 1505 aa35.3■■■■□ 3.24
COPE-204ENST00000593827 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
COPE-204ENST00000593827 OSCARQ8IYS5 282 aa35.27■■■■□ 3.24
COPE-204ENST00000593827 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.27■■■■□ 3.24
COPE-204ENST00000593827 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
COPE-204ENST00000593827 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.21■■■■□ 3.23
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COPE-204ENST00000593827 WDR97A6NE52 1622 aa35.13■■■■□ 3.21
COPE-204ENST00000593827 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
COPE-204ENST00000593827 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.08■■■■□ 3.21
COPE-204ENST00000593827 TRIM41Q8WV44 630 aa35.08■■■■□ 3.21
COPE-204ENST00000593827 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.96■■■■□ 3.19
COPE-204ENST00000593827 TOP2BQ02880 1626 aa34.95■■■■□ 3.19
COPE-204ENST00000593827 GRIN2BQ13224 1484 aa34.95■■■■□ 3.19
COPE-204ENST00000593827 FBLN2P98095 1184 aa34.93■■■■□ 3.18
COPE-204ENST00000593827 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.91■■■■□ 3.18
COPE-204ENST00000593827 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.89■■■■□ 3.18
COPE-204ENST00000593827 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
COPE-204ENST00000593827 SYNJ1O43426 1573 aa34.87■■■■□ 3.17
COPE-204ENST00000593827 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.86■■■■□ 3.17
COPE-204ENST00000593827 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
COPE-204ENST00000593827 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.74■■■■□ 3.15
COPE-204ENST00000593827 CHD1O14646 1710 aa34.74■■■■□ 3.15
COPE-204ENST00000593827 SYNJ2O15056 1496 aa34.73■■■■□ 3.15
COPE-204ENST00000593827 PBRM1Q86U86 1689 aa34.66■■■■□ 3.14
COPE-204ENST00000593827 ARHGEF11O15085 1522 aa34.55■■■■□ 3.12
COPE-204ENST00000593827 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.55■■■■□ 3.12
COPE-204ENST00000593827 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.52■■■■□ 3.12
COPE-204ENST00000593827 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.52■■■■□ 3.12
COPE-204ENST00000593827 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.52■■■■□ 3.12
COPE-204ENST00000593827 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.51■■■■□ 3.12
COPE-204ENST00000593827 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.45■■■■□ 3.11
COPE-204ENST00000593827 ADAMTS12P58397 1594 aa34.45■■■■□ 3.11
COPE-204ENST00000593827 GRIN2AQ12879 1464 aa34.45■■■■□ 3.1
COPE-204ENST00000593827 KIF27Q86VH2 1401 aa34.42■■■■□ 3.1
COPE-204ENST00000593827 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.33■■■■□ 3.09
COPE-204ENST00000593827 NUP160Q12769 1436 aa34.3■■■■□ 3.08
COPE-204ENST00000593827 IGF1RP08069 1367 aa34.25■■■■□ 3.07
COPE-204ENST00000593827 ARAP1Q96P48 1450 aa34.24■■■■□ 3.07
COPE-204ENST00000593827 CEP170Q5SW79 1584 aa34.19■■■■□ 3.06
COPE-204ENST00000593827 CUL7Q14999 1698 aa34.15■■■■□ 3.06
COPE-204ENST00000593827 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.09■■■■□ 3.05
COPE-204ENST00000593827 JPH4Q96JJ6 628 aa34.02■■■■□ 3.04
COPE-204ENST00000593827 SHROOM2Q13796 1616 aa33.99■■■■□ 3.03
COPE-204ENST00000593827 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.96■■■■□ 3.03
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