Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD17-219ENST00000521422 2323 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD8-259ENST00000642042 2303 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP8B1-202ENST00000437102 1896 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF067845.2-201ENST00000617093 3049 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIMA1-201ENST00000341247 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138749.1-201ENST00000567652 2472 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00558-201ENST00000569422 3163 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092017.4-202ENST00000638931 2006 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FITM2-201ENST00000396825 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACVR2A-202ENST00000404590 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SGO1-AS1-204ENST00000634618 2371 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016526.3-201ENST00000624275 3931 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACSL6-203ENST00000379240 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDNF-201ENST00000326524 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGLYRP4-201ENST00000359650 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092802.1-201ENST00000421762 2447 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAX1-203ENST00000442561 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPS7A-203ENST00000534877 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXP1-220ENST00000614176 6384 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF80-203ENST00000619534 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCN2-203ENST00000407817 1870 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD207-201ENST00000410009 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms