Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AKIP1Q9NQ31 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AKIP1Q9NQ31 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms