Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD12Q8N8I0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms