Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 ANKRD12-209ENST00000585234 313 ntTSL 312.97□□□□□ -0.335e-8■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 ANXA4-205ENST00000460942 576 ntTSL 510.36□□□□□ -0.754e-18■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 ANXA4-209ENST00000477632 3949 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.964e-18■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 CASC3-205ENST00000577605 714 ntTSL 36.77□□□□□ -1.335e-8■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 AGO2-202ENST00000517293 422 ntTSL 36.77□□□□□ -1.335e-8■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 TIA1-219ENST00000496452 853 ntTSL 215.4■□□□□ 0.068e-16■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 TIA1-202ENST00000361692 543 ntTSL 54.76□□□□□ -1.658e-16■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-9■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 SNHG14-211ENST00000547292 626 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-7■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 36.7□□□□□ -1.342e-33■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 NCOR1-206ENST00000411510 1883 ntTSL 1 (best)22.88■■□□□ 1.257e-8■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 NCOR1-211ENST00000460276 1848 ntTSL 222.7■■□□□ 1.227e-8■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 NCOR1-221ENST00000582357 1877 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.917e-8■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 GTF3A-202ENST00000419181 1191 ntTSL 1 (best)19.74■□□□□ 0.757e-8■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.647e-8■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.317e-8■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 RNF220-209ENST00000474064 2734 ntTSL 221.95■■□□□ 1.12e-6■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 11.5
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AGGF1Q8N302 RNF220-211ENST00000474956 3303 ntTSL 213.01□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.611e-6■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 54.68□□□□□ -1.663e-7■■□□□ 11.5
AGGF1Q8N302 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.297e-9■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC9.88□□□□□ -0.831e-7■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 57.43□□□□□ -1.221e-7■■□□□ 11.4
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AGGF1Q8N302 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.346e-16■■□□□ 11.4
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AGGF1Q8N302 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-9■■□□□ 11.4
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AGGF1Q8N302 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-7■■□□□ 11.4
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AGGF1Q8N302 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.32e-7■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 HPS5-209ENST00000544218 759 ntTSL 36.55□□□□□ -1.362e-7■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 HPS5-208ENST00000543728 320 ntTSL 53.12□□□□□ -1.912e-7■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.748e-7■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.333e-8■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 RSL1D1-203ENST00000570767 871 ntTSL 58.86□□□□□ -0.993e-8■■□□□ 11.4
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AGGF1Q8N302 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-204ENST00000474374 1161 ntTSL 513.57□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-214ENST00000638917 2306 ntTSL 513.13□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-221ENST00000640081 2385 ntTSL 512.9□□□□□ -0.342e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-211ENST00000638508 2163 ntTSL 512.32□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-207ENST00000638347 1651 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■■□□□ 11.4
AGGF1Q8N302 ELP4-208ENST00000638376 1096 ntTSL 511.66□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 11.4
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