Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-7■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-7■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-7■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 NDUFC1-205ENST00000503997 628 ntTSL 311.46□□□□□ -0.573e-7■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 FAM120A-204ENST00000446420 1701 ntTSL 510.78□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 ALDH1A2-221ENST00000560312 3146 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.723e-7■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 ALDH1A2-209ENST00000558384 466 ntTSL 35.02□□□□□ -1.613e-7■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.029e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.129e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.179e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-203ENST00000393088 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.279e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-210ENST00000489769 1562 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.389e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-202ENST00000393087 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.399e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.429e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.439e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.69e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.769e-48■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.341e-12■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.058e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.738e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 SLC38A2-213ENST00000553252 846 ntTSL 218.76■□□□□ 0.598e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.188e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.148e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.128e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.268e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-12■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 AKR1C1-204ENST00000476100 713 ntTSL 211.81□□□□□ -0.528e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.861e-12■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 27.8□□□□□ -1.168e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.38e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.48e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 55.33□□□□□ -1.568e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.668e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 TFPI-212ENST00000481389 599 ntTSL 54.64□□□□□ -1.678e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.748e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 58.99□□□□□ -0.974e-67■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 26.78□□□□□ -1.324e-67■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 NPM1-211ENST00000523622 247 ntTSL 36.69□□□□□ -1.344e-67■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.364e-67■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 NPM1-210ENST00000523339 268 ntTSL 24.08□□□□□ -1.764e-67■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.16e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 DDX5-214ENST00000580026 1171 ntTSL 211.24□□□□□ -0.616e-9■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 218.78■□□□□ 0.62e-14■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 BSG-216ENST00000618112 769 ntTSL 216.83■□□□□ 0.282e-14■□□□□ 8.6
NOLC1Q14978 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.484e-74■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TMEM14C-203ENST00000467415 899 ntTSL 315.77■□□□□ 0.125e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.085e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.075e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -05e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TOMM7-204ENST00000463284 731 ntTSL 214.32□□□□□ -0.125e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.125e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.385e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TOMM7-205ENST00000483581 551 ntTSL 1 (best)3.1□□□□□ -1.915e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YOD1-201ENST00000315927 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 ORM1-202ENST00000477456 422 ntTSL 210.32□□□□□ -0.764e-11■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.044e-11■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 PTPRS-209ENST00000591760 478 ntTSL 228.2■■■□□ 2.13e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.623e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.563e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 524.04■■□□□ 1.443e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.33e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 ALCAM-204ENST00000470756 1770 ntTSL 1 (best)22.42■■□□□ 1.183e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 521.48■■□□□ 1.033e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.013e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.993e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 221.14■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.943e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 320.82■□□□□ 0.923e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FARSA-210ENST00000593021 1135 ntTSL 520.59■□□□□ 0.893e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.873e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.73e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 LRP1-203ENST00000451724 1284 ntTSL 519.1■□□□□ 0.653e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.583e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-218ENST00000454523 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.46■□□□□ 0.553e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.553e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-202ENST00000421879 583 ntTSL 318.28■□□□□ 0.523e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-219ENST00000545245 709 ntTSL 418.28■□□□□ 0.523e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.53e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.53e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.493e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.473e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.383e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.44■□□□□ 0.383e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 316.28■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 215.23■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FARSA-205ENST00000587488 514 ntTSL 315.22■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 315.15■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.013e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.033e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 FADS1-203ENST00000424501 926 ntTSL 314.54□□□□□ -0.083e-9■□□□□ 8.5
NOLC1Q14978 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-6■□□□□ 8.5
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 350.8 ms