Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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