Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB3Q05901 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms