Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L3A6NEY3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms