Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSHZ2Q9NRE2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms