Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S3

TMPRSS5, Transmembrane protease serine 5, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS5Q9H3S3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS5Q9H3S3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS5Q9H3S3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms