Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 GRB2-211ENST00000583912 561 ntTSL 48.51□□□□□ -1.052e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DENND1B-202ENST00000294737 3043 ntTSL 217■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DENND1B-201ENST00000235453 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 WT1-207ENST00000527775 578 ntTSL 513.07□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-202ENST00000392481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-208ENST00000447345 785 ntTSL 211.71□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-206ENST00000427785 485 ntTSL 311.25□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 PHKA1-203ENST00000373542 6020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-201ENST00000296273 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-214ENST00000494047 1393 ntTSL 210.86□□□□□ -0.671e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-207ENST00000433496 1111 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-210ENST00000449502 799 ntTSL 38.97□□□□□ -0.971e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 WT1-208ENST00000527882 551 ntTSL 58.07□□□□□ -1.121e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-213ENST00000489028 533 ntTSL 34.97□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RFC4-205ENST00000418288 701 ntTSL 24.87□□□□□ -1.631e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 RNF217-209ENST00000519971 274 ntTSL 311.46□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 OGT-203ENST00000444774 556 ntTSL 410.38□□□□□ -0.752e-8■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 39.25□□□□□ -0.932e-8■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.262e-8■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.362e-8■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 56.05□□□□□ -1.442e-8■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 OGT-211ENST00000498566 601 ntTSL 35.02□□□□□ -1.612e-8■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.046e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 B4GALT2-206ENST00000485678 943 ntTSL 319.16■□□□□ 0.666e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.66e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.326e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 44.34□□□□□ -1.712e-8■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 ZZZ3-210ENST00000476275 4737 ntTSL 25.29□□□□□ -1.567e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.687e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 ZZZ3-211ENST00000481346 4500 ntTSL 1 (best)3.35□□□□□ -1.877e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 ZFPM2-202ENST00000511341 1582 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 LPCAT1-206ENST00000514484 756 ntTSL 318.89■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 517.46■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.442e-9■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.257e-9■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 NECAB3-212ENST00000485976 1016 ntTSL 522.45■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 NECAB3-207ENST00000478237 827 ntTSL 222.45■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 22.1
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TARDBPQ13148 NECAB3-209ENST00000483813 1277 ntTSL 519.9■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 22.1
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TARDBPQ13148 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 419.49■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 219.15■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 22.1
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TARDBPQ13148 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)20.99■□□□□ 0.956e-7■■■■□ 22.1
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TARDBPQ13148 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 FAM120A-204ENST00000446420 1701 ntTSL 59.19□□□□□ -0.943e-7■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 IL11RA-209ENST00000555247 1669 ntTSL 522.72■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 22.1
TARDBPQ13148 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 22.1
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TARDBPQ13148 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 524.01■■□□□ 1.439e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-210ENST00000540031 960 ntTSL 1 (best)23.49■■□□□ 1.359e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MTMR14-210ENST00000447144 1664 ntTSL 221.91■■□□□ 1.19e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ILKAP-209ENST00000490837 557 ntTSL 421.81■■□□□ 1.089e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.049e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.979e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.969e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.959e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-203ENST00000438628 559 ntTSL 220.73■□□□□ 0.919e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 320.39■□□□□ 0.859e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC38A1-208ENST00000550173 891 ntTSL 520.26■□□□□ 0.839e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 520.23■□□□□ 0.839e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.89e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.769e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.719e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ILKAP-210ENST00000498727 587 ntTSL 219.26■□□□□ 0.679e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ILKAP-207ENST00000467133 618 ntTSL 419.23■□□□□ 0.679e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.669e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 318.67■□□□□ 0.589e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.569e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.529e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ILKAP-203ENST00000457149 793 ntTSL 517.63■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 417.58■□□□□ 0.49e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 217.52■□□□□ 0.49e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 216.98■□□□□ 0.319e-7■■■■□ 22
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