Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms