Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL23P62829 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL23P62829 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms