Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms