Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC113Q9H0I3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC113Q9H0I3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms