Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLDIP3Q9BY77 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms