Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms