Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms