Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOX2P48431 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX2P48431 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOX2P48431 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOX2P48431 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SOX2P48431 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX2P48431 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX2P48431 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX2P48431 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms