Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOX2P48431 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SOX2P48431 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOX2P48431 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SOX2P48431 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX2P48431 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX2P48431 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX2P48431 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX2P48431 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX2P48431 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX2P48431 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX2P48431 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX2P48431 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX2P48431 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX2P48431 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX2P48431 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX2P48431 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOX2P48431 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX2P48431 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SOX2P48431 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOX2P48431 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOX2P48431 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX2P48431 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX2P48431 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX2P48431 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX2P48431 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX2P48431 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX2P48431 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX2P48431 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX2P48431 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX2P48431 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX2P48431 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX2P48431 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX2P48431 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SOX2P48431 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX2P48431 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX2P48431 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX2P48431 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX2P48431 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX2P48431 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX2P48431 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX2P48431 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX2P48431 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX2P48431 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX2P48431 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX2P48431 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX2P48431 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX2P48431 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX2P48431 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX2P48431 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX2P48431 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX2P48431 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX2P48431 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX2P48431 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX2P48431 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX2P48431 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX2P48431 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX2P48431 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX2P48431 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX2P48431 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX2P48431 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX2P48431 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX2P48431 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX2P48431 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX2P48431 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX2P48431 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX2P48431 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX2P48431 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX2P48431 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX2P48431 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX2P48431 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX2P48431 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOX2P48431 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX2P48431 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX2P48431 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX2P48431 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX2P48431 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX2P48431 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX2P48431 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX2P48431 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX2P48431 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX2P48431 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX2P48431 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX2P48431 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX2P48431 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX2P48431 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX2P48431 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX2P48431 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX2P48431 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX2P48431 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOX2P48431 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX2P48431 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX2P48431 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX2P48431 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX2P48431 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX2P48431 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX2P48431 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX2P48431 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX2P48431 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SOX2P48431 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms