Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDPSP14324 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDPSP14324 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDPSP14324 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDPSP14324 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDPSP14324 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDPSP14324 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDPSP14324 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FDPSP14324 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FDPSP14324 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDPSP14324 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDPSP14324 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDPSP14324 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDPSP14324 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDPSP14324 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FDPSP14324 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FDPSP14324 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FDPSP14324 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FDPSP14324 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FDPSP14324 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms