Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.997e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 212.3□□□□□ -0.441e-9■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 PSME2-207ENST00000559056 512 ntTSL 510.07□□□□□ -0.81e-11■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.663e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.473e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.63e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.738e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.12e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 PSMA7-205ENST00000484488 1023 ntTSL 329.21■■■□□ 2.272e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.052e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 DARS-210ENST00000489964 827 ntTSL 211.49□□□□□ -0.579e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SRP68-206ENST00000587864 577 ntTSL 23.84□□□□□ -1.792e-7■■□□□ 11.8
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G3BP1Q13283 SDHA-209ENST00000509082 434 ntTSL 514.86□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SDHA-219ENST00000515815 704 ntTSL 314.86□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-10■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.744e-10■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.924e-10■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.044e-10■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.24e-10■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 SH3D19-207ENST00000478503 4038 ntTSL 27.24□□□□□ -1.254e-10■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 ACACA-243ENST00000618575 772 ntTSL 43.03□□□□□ -1.921e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 UPF1-210ENST00000600689 3084 ntTSL 221.57■■□□□ 1.047e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 UPF1-204ENST00000596842 3825 ntTSL 218.21■□□□□ 0.517e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 PSMD4-211ENST00000476855 1232 ntTSL 219.63■□□□□ 0.731e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 PGD-208ENST00000493288 476 ntTSL 314.16□□□□□ -0.143e-13■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 G3BP2-211ENST00000507947 665 ntTSL 27.84□□□□□ -1.154e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 G3BP2-215ENST00000510902 338 ntTSL 32.76□□□□□ -1.974e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 TRAP1-214ENST00000575854 595 ntTSL 315.46■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 STIP1-206ENST00000538497 582 ntTSL 26.97□□□□□ -1.297e-8■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 328.01■■■□□ 2.072e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 GTF3C1-209ENST00000568569 540 ntTSL 514.47□□□□□ -0.093e-6■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 MTHFD1-204ENST00000553405 833 ntTSL 218.4■□□□□ 0.544e-7■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 DDB1-209ENST00000537877 1375 ntTSL 215.25■□□□□ 0.032e-9■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 GALK1-206ENST00000589030 866 ntTSL 224.7■■□□□ 1.546e-9■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.456e-8■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.256e-8■■□□□ 11.8
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G3BP1Q13283 SEPT9-225ENST00000589250 527 ntTSL 211.82□□□□□ -0.521e-13■■□□□ 11.8
G3BP1Q13283 PHB-213ENST00000513412 650 ntTSL 213.22□□□□□ -0.293e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.71e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 HCFC1-203ENST00000444191 3624 ntTSL 513.94□□□□□ -0.184e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.84e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 SDHA-214ENST00000511810 3001 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 EWSR1-216ENST00000479135 7285 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.364e-8■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 GSR-202ENST00000521479 582 ntTSL 312.33□□□□□ -0.441e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC16.28■□□□□ 0.22e-8■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 AAMP-209ENST00000489767 1833 ntTSL 519.51■□□□□ 0.715e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 AAMP-208ENST00000475678 2270 ntTSL 219.3■□□□□ 0.685e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.385e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ITPR2-203ENST00000451599 2577 ntTSL 1 (best)11.81□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 11.7
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G3BP1Q13283 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 325.87■■□□□ 1.735e-8■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 RALY-210ENST00000493399 513 ntTSL 517.99■□□□□ 0.475e-8■■□□□ 11.7
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G3BP1Q13283 AP2B1-216ENST00000616784 2542 ntTSL 59.43□□□□□ -0.98e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ALDH4A1-203ENST00000432718 844 ntTSL 320■□□□□ 0.792e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 522.25■■□□□ 1.159e-10■■□□□ 11.7
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G3BP1Q13283 TAF15-208ENST00000604360 409 ntTSL 321.22■□□□□ 0.991e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 PDHA1-208ENST00000478795 791 ntTSL 214.2□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.831e-6■■□□□ 11.7
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G3BP1Q13283 DHX38-207ENST00000566329 683 ntTSL 221.74■■□□□ 1.079e-11■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 FAH-205ENST00000558022 568 ntTSL 418.58■□□□□ 0.567e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 DIAPH1-210ENST00000494967 629 ntTSL 217.54■□□□□ 0.42e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 PHB-211ENST00000511933 852 ntTSL 214.55□□□□□ -0.082e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 DIAPH1-209ENST00000491754 557 ntTSL 414.51□□□□□ -0.092e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 DIAPH1-212ENST00000518484 546 ntTSL 48.91□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 HIF1A-208ENST00000556237 595 ntTSL 47.82□□□□□ -1.169e-11■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 HIF1A-210ENST00000557206 767 ntTSL 35.36□□□□□ -1.559e-11■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 DDB1-211ENST00000538280 227 ntTSL 311.16□□□□□ -0.621e-9■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ACAA1-204ENST00000418880 737 ntTSL 324.63■■□□□ 1.539e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ACAA1-213ENST00000465181 656 ntTSL 315.51■□□□□ 0.079e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-208ENST00000449130 526 ntTSL 319.13■□□□□ 0.653e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-203ENST00000405384 1905 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.273e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.063e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-207ENST00000443098 775 ntTSL 513.99□□□□□ -0.173e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.293e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.433e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.813e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 CAP1-211ENST00000421589 824 ntTSL 220.06■□□□□ 0.84e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 413.92□□□□□ -0.184e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 CAP1-213ENST00000427843 739 ntTSL 512.6□□□□□ -0.394e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 CAP1-212ENST00000424977 702 ntTSL 57.98□□□□□ -1.134e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.372e-6■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.014e-7■■□□□ 11.7
G3BP1Q13283 UBE2Z-204ENST00000506498 766 ntTSL 413.83□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 11.7
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