Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.886e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.926e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.966e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.035e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.745e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)19.45■□□□□ 0.78e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 212.04□□□□□ -0.488e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.548e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.578e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.268e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.936e-8■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ANTXR2-201ENST00000307333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.916e-8■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 CNOT1-214ENST00000568917 1317 ntTSL 58.64□□□□□ -1.032e-11■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 CNOT1-205ENST00000563283 551 ntTSL 34.96□□□□□ -1.622e-11■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.416e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ASXL2-204ENST00000497092 549 ntTSL 25.5□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ZEB2-230ENST00000629955 1435 ntTSL 513.27□□□□□ -0.298e-9■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.869e-7■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ST6GAL1-216ENST00000458216 507 ntTSL 312.37□□□□□ -0.433e-10■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ST6GAL1-206ENST00000430309 504 ntTSL 48.21□□□□□ -1.13e-10■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 ST6GAL1-203ENST00000417392 707 ntTSL 27.95□□□□□ -1.143e-10■■■■□ 22.4
TARDBPQ13148 STIP1-210ENST00000540887 877 ntTSL 215.16■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.486e-7■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NRF1-205ENST00000393232 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-7■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GALNT10-210ENST00000521786 600 ntTSL 327.59■■■□□ 2.011e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GALNT10-208ENST00000520647 4359 ntTSL 218.05■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GALNT10-209ENST00000521781 703 ntTSL 59.56□□□□□ -0.881e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MFAP3-204ENST00000519325 944 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-8■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.82e-8■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 53.72□□□□□ -1.812e-8■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-211ENST00000490316 713 ntTSL 329.44■■■□□ 2.34e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.824e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.334e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-209ENST00000485376 2973 ntTSL 1 (best)21.74■■□□□ 1.074e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.344e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.534e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NEK1-205ENST00000510108 1304 ntTSL 59.46□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.984e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.994e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GRAP2-203ENST00000420971 568 ntTSL 27.49□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 GRAP2-206ENST00000478445 583 ntTSL 46.34□□□□□ -1.394e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-213ENST00000493995 700 ntTSL 55.79□□□□□ -1.484e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NEK1-204ENST00000509912 2971 ntTSL 25.55□□□□□ -1.524e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-206ENST00000438018 397 ntTSL 55.24□□□□□ -1.574e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-205ENST00000436701 448 ntTSL 55.15□□□□□ -1.594e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-203ENST00000429965 564 ntTSL 54.75□□□□□ -1.654e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-204ENST00000434699 549 ntTSL 54.23□□□□□ -1.734e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MTMR1-207ENST00000439546 573 ntTSL 44.2□□□□□ -1.744e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 420.78■□□□□ 0.923e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 RAB10-204ENST00000495146 1292 ntTSL 523.73■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 ERI3-209ENST00000495828 972 ntTSL 322.76■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2E1-207ENST00000475680 1138 ntTSL 521.92■■□□□ 1.12e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 321.82■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 12e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2E1-211ENST00000495141 582 ntTSL 215.6■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-219ENST00000597636 2874 ntTSL 514.91□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2E1-204ENST00000442670 622 ntTSL 214.85□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-211ENST00000596644 550 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 514.55□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 314.37□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.3
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