Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HELQQ8TDG4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELQQ8TDG4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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