Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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