Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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