Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ANKRD42Q8N9B4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ANKRD42Q8N9B4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ANKRD42Q8N9B4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ANKRD42Q8N9B4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ANKRD42Q8N9B4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ANKRD42Q8N9B4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ANKRD42Q8N9B4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ANKRD42Q8N9B4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ANKRD42Q8N9B4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ANKRD42Q8N9B4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ANKRD42Q8N9B4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ANKRD42Q8N9B4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ANKRD42Q8N9B4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ANKRD42Q8N9B4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ANKRD42Q8N9B4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ANKRD42Q8N9B4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ANKRD42Q8N9B4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ANKRD42Q8N9B4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ANKRD42Q8N9B4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ANKRD42Q8N9B4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ANKRD42Q8N9B4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ANKRD42Q8N9B4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ANKRD42Q8N9B4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ANKRD42Q8N9B4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ANKRD42Q8N9B4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ANKRD42Q8N9B4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ANKRD42Q8N9B4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ANKRD42Q8N9B4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ANKRD42Q8N9B4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ANKRD42Q8N9B4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ANKRD42Q8N9B4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ANKRD42Q8N9B4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ANKRD42Q8N9B4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ANKRD42Q8N9B4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ANKRD42Q8N9B4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ANKRD42Q8N9B4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ANKRD42Q8N9B4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ANKRD42Q8N9B4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ANKRD42Q8N9B4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ANKRD42Q8N9B4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ANKRD42Q8N9B4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ANKRD42Q8N9B4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ANKRD42Q8N9B4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ANKRD42Q8N9B4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ANKRD42Q8N9B4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ANKRD42Q8N9B4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ANKRD42Q8N9B4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ANKRD42Q8N9B4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ANKRD42Q8N9B4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ANKRD42Q8N9B4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ANKRD42Q8N9B4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ANKRD42Q8N9B4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ANKRD42Q8N9B4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ANKRD42Q8N9B4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ANKRD42Q8N9B4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ANKRD42Q8N9B4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ANKRD42Q8N9B4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ANKRD42Q8N9B4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ANKRD42Q8N9B4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ANKRD42Q8N9B4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ANKRD42Q8N9B4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD42Q8N9B4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD42Q8N9B4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANKRD42Q8N9B4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ANKRD42Q8N9B4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD42Q8N9B4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD42Q8N9B4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD42Q8N9B4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD42Q8N9B4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD42Q8N9B4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD42Q8N9B4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD42Q8N9B4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ANKRD42Q8N9B4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ANKRD42Q8N9B4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD42Q8N9B4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD42Q8N9B4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ANKRD42Q8N9B4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ANKRD42Q8N9B4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ANKRD42Q8N9B4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ANKRD42Q8N9B4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ANKRD42Q8N9B4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ANKRD42Q8N9B4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ANKRD42Q8N9B4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ANKRD42Q8N9B4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ANKRD42Q8N9B4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ANKRD42Q8N9B4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ANKRD42Q8N9B4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ANKRD42Q8N9B4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ANKRD42Q8N9B4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ANKRD42Q8N9B4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ANKRD42Q8N9B4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ANKRD42Q8N9B4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ANKRD42Q8N9B4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ANKRD42Q8N9B4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ANKRD42Q8N9B4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ANKRD42Q8N9B4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ANKRD42Q8N9B4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
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