Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms