Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB25P57735 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB25P57735 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB25P57735 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB25P57735 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB25P57735 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB25P57735 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms