Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDRG4Q9ULP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDRG4Q9ULP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDRG4Q9ULP0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDRG4Q9ULP0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms