Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC23Q9UJX2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDC23Q9UJX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC23Q9UJX2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC23Q9UJX2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC23Q9UJX2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms