Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-2Q9UD57 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-2Q9UD57 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-2Q9UD57 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKX1-2Q9UD57 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX1-2Q9UD57 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX1-2Q9UD57 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms