Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFY2Q9P0M6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFY2Q9P0M6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFY2Q9P0M6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFY2Q9P0M6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFY2Q9P0M6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms