Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD4L1Q9NU39 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD4L1Q9NU39 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXD4L1Q9NU39 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD4L1Q9NU39 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms