Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PARP11Q9NR21 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PARP11Q9NR21 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP11Q9NR21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP11Q9NR21 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP11Q9NR21 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms