Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP11Q9NR21 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP11Q9NR21 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP11Q9NR21 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP11Q9NR21 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP11Q9NR21 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP11Q9NR21 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP11Q9NR21 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP11Q9NR21 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP11Q9NR21 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP11Q9NR21 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP11Q9NR21 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP11Q9NR21 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP11Q9NR21 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP11Q9NR21 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP11Q9NR21 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP11Q9NR21 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP11Q9NR21 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP11Q9NR21 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP11Q9NR21 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP11Q9NR21 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP11Q9NR21 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PARP11Q9NR21 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARP11Q9NR21 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARP11Q9NR21 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARP11Q9NR21 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARP11Q9NR21 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARP11Q9NR21 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP11Q9NR21 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP11Q9NR21 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARP11Q9NR21 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP11Q9NR21 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP11Q9NR21 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP11Q9NR21 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP11Q9NR21 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP11Q9NR21 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP11Q9NR21 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP11Q9NR21 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP11Q9NR21 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP11Q9NR21 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP11Q9NR21 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP11Q9NR21 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP11Q9NR21 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP11Q9NR21 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP11Q9NR21 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP11Q9NR21 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP11Q9NR21 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP11Q9NR21 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP11Q9NR21 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP11Q9NR21 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP11Q9NR21 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP11Q9NR21 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP11Q9NR21 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP11Q9NR21 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP11Q9NR21 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP11Q9NR21 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP11Q9NR21 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP11Q9NR21 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP11Q9NR21 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP11Q9NR21 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARP11Q9NR21 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARP11Q9NR21 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP11Q9NR21 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP11Q9NR21 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP11Q9NR21 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP11Q9NR21 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP11Q9NR21 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP11Q9NR21 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP11Q9NR21 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP11Q9NR21 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP11Q9NR21 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP11Q9NR21 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP11Q9NR21 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP11Q9NR21 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP11Q9NR21 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP11Q9NR21 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP11Q9NR21 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP11Q9NR21 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP11Q9NR21 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP11Q9NR21 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP11Q9NR21 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP11Q9NR21 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP11Q9NR21 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP11Q9NR21 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARP11Q9NR21 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARP11Q9NR21 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP11Q9NR21 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP11Q9NR21 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP11Q9NR21 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP11Q9NR21 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms