Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPHS2Q9NP85 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NPHS2Q9NP85 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPHS2Q9NP85 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPHS2Q9NP85 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPHS2Q9NP85 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPHS2Q9NP85 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms