Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNDIG1Q9H7V2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNDIG1Q9H7V2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNDIG1Q9H7V2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNDIG1Q9H7V2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNDIG1Q9H7V2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNDIG1Q9H7V2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.1 ms