Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSTN2Q9H4D0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSTN2Q9H4D0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSTN2Q9H4D0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLSTN2Q9H4D0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms