Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARHL1Q9BZE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BARHL1Q9BZE3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARHL1Q9BZE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARHL1Q9BZE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms